通讯员 左彦 科技日报记者 代小佩
3月17日，首都医科大学附属北京世纪坛医院胃肠肝胆肿瘤外科彭吉润教授课题组和北京大学生物医学前沿创新中心张泽民教授课题组合作，在国际期刊《肿瘤细胞》（Cancer Cell）上在线发表研究论文，解析了肿瘤免疫微环境形成因素。
肿瘤微环境特征与免疫检查点抑制剂的治疗效果密切相关，系统解析肿瘤微环境中不同免疫细胞的表型，是理解肿瘤发生、发展机理以及提高免疫治疗效果的关键。上述研究以结直肠癌肝转移为模型，利用单细胞转录组测序技术系统研究了肿瘤微环境如何形成这一问题，并给出了新认识、新见解。
该研究中，课题组收集了一组未经治疗的结直肠癌肝转移患者包括原发肠癌及癌旁组织、肝转移癌及癌旁组织、肠系膜淋巴结和外周血在内的配对样本，对32万3千多个细胞进行了10x Genomics测序，同时还对5000多个细胞采用Smart-seq 2方法进行了测序验证。通过整合多种scRNA-seq平台的表达谱数据和T细胞受体序列测序结果，研究人员构建了结直肠癌肝转移患者多种组织的高分辨率免疫细胞转录组图谱，并为后续相关研究工作提供了极有价值的数据资源。
为了量化分析肿瘤细胞成分和驻留组织/器官生境对各种免疫细胞不同表型的影响，研究人员设计了一种被称为PhenoAligner的算法，表型显著受到恶性肿瘤细胞影响的免疫类群被定义为M-type，而表型显著受到组织/器官生境影响的免疫类群则被定义为N-type。研究人员还识别出多种与肿瘤进展或转移相关的关键性免疫细胞。此外，研究人员鉴定出三群分别高表达SPP1、C1QC和MKI67的肿瘤相关巨噬细胞。
关键词： 肿瘤免疫
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